In Europa würzt Muskatnuss Eintopf- und Gemüsegerichten, Kalbfleisch, Fleisch-kuchen, Käse- und Eierspeisen.
Auch Süßspeisen wie Honigkuchen, Fruchtkuchen und Fruchtpuddings erhalten durch Muskatnuss einen besonderen Pfiff.
In orientalischen Ländern wird sie gerne für Lamm- und Schaffleisch verwendet.